Ist der vHost der gelöschten Domain noch als Verzeichnis auf deinem Server vorhanden?
Falls nicht, kannst du die Domain bedenkenlos aus der Datenbank löschen.
Ich frage ja Grade extra hier weil ihr Ahnung habt ...
Ich bin noch kein hoster will es aber werden und bin halt dabei
ispcp einzurichten bekomme einen Fehler und frage hier nach wie man ihn beheben kann
Wenn der Ordner gelöscht ist, wurde auch alles andere von der Domain gelöscht.
Von daher ist der Eintrag im ispCP nur noch eine Leiche und du kannst sie bedenkenlos aus der ispCP-Datenbank löschen.
Sollte dir dein Apache nach einem Neustart Fehlermeldungen ausspucken, so lies dir diese durch und passie die betreffende Configs an.