Zuerst mal: Hast du PHP mit suhosin kompiliert (=Patch) oder als Extension hinzugefügt (=extension=suhosin.so) oder beides?
All die suhosin Funktionen sind übrigens sowieso in der Erweiterung drin - und wenn die Erweiterung aktiviert ist (was ich laut deinem Post daraus schliesse, weil du ja sagst, es gibt Fehlermeldungen), dann musst du in der php.ini auch zwingend Einträge haben (zumindest mal "extension=suhosin.so").
Was mir noch einfällt: Hast du PHP selbst kompiliert oder die PHP-Pakete von SuSE genommen? In dem Fall bezweifle ich, dass die php.ini überhaupt durch die suhosin-Installation beinflusst wurde.