1. Möglichkeit: Falls Courrier im Maildir-Format konfiguriert ist, könntest Du auch die Verzeichnisse analysieren und diese mit "cyradm" erstellen. Anschließend kannst Du einzelnen Mail-Dateien in "deliver" rein-pipen und dabei das korrekte IMAP-Verzeichnis angeben.
2. Möglichkeit: Du könntest den alten Dienst (Courrier) umkonfigurieren, so dass er auf einem anderen Port antwortet und den neuen Dienst standardmäßig konfigurieren. Dann kannst Du mit fetchmail die Mails aus den alten Mailboxen holen und über das Mailsystem in die neuen Mailboxen zustellen.
Dabei solltest Du überprüfen, ob bestimmte Headerzeilen entfernen musst, damit der MTA nicht eine Mailloop erkennt.