Hmm, in Plesk habe ich gesehen, dass meine HD irgendwie voll war.
Hab jetzt mal ein paar Sachen gelöscht um Platz zu schaffen und das System neu gebootet, momentan ist kein perl Prozess mit 100% CPU Last gelistet.
Ich hatte, bevor ich merkte, dass die Platte voll ist, schon mal neu gebootet und da war der perl Prozess hinterher auch gleich wieder da, vermute also es lag irgendwie am mangelnden Festplatten Platz.