Wie groß ist denn die Platte? Könnte das einfach ein lang laufender fsck sein?
Ansonsten: Booten, Reset, Rescue -> Logs durchstöbern.
Wenn keine Logs geschrieben wurden, konnte er die Platten nicht mounten. Dann bleibt eigentlich nur BIOS, Bootloader, Kernel oder fstab.
LVM, Soft-RAID oder...