Wenn ich das richtig in Erinnerung habe, enthält $_ENV immer nur die Umgebungsvariablen die von der Shell oder dem Apache zur Verfügung gestellt werden.
Da du das Script auf der Shell und nicht im Browser aufgerufen hast, könnte eventuell von vorher ausgeführten Scripten (z.B. ein manueller Aufruf dieses Backup-Managers) noch diese Umgebungsvariable gesetzt sein.
Wenn du "export" auf der Konsole aufrufst, müsstest du diese Variable ebenfalls sehen.